如果重卡发动机的传动轴高度被抬高三公分，那么会对发动机的正常运行产生一定的影响。传动轴的高度对于发动机的性能和稳定性至关重要。抬高传动轴可能会使其过于高，这将影响传动效率，同时还会使车辆重心偏高，从而导致操控性下降和转向不足的风险增加。此外，如果传动轴的高度过高，还可能会导致传动轴的损坏或断裂，这将会对车辆的安全性和可靠性产生负面影响。

　　因此，建议在安装重卡发动机传动轴时，请确保其高度在正常范围内，并遵守安装标准和操作规程。如果有任何疑虑或问题，最好寻求专业的技术支持。