双孢菇播种后2-3天内，菇棚（房）内以保湿为主，微量透风为辅，不能不透风。通风孔要加防虫网。棚温以22-24℃为宜，料温24-26℃为好。

播种后4-6天，菌丝已开始或已长入培养料，应以换气为主，小通风为辅，适当增加通风量，促进菌丝向料内生长，防止杂菌滋生。同时要检查菌种成活情况（若有的投成活可补播）和床面杂菌情况。发现毛霉要加大通风、降低空气湿度、控制发展；发现有绿霉点，可在霉点上摊由石灰、黏土和漂白粉三合一的泥糊，控制其蔓延和传播。为了防止杂菌滋生，播种3天后，在空中喷洒0.1%克霉灵或0.5%甲醛溶液。

播种后7-12天为发菌旺盛期，应蛆小通风为主，大通风为辅，促使菌丝快速纵横生长，发足发壮菌丝。若生长不快，可用铁叉适当撬料，增加透气性，促进菌丝生长。

当菌丝生长到料层1/2时，一般进行撬料，以加快发菌速度。

播种后12-20天为培养料发菌后期，当菌丝长到料层2/3时，及时覆土。覆土晚一天，出菇晚十天。因此，适时覆土很重要。