黄花菜种子繁殖属黄花菜的有性繁殖。选择优良高产植株，于盛花期每茎留5~6个健壮的花蕾让其开花结果，其他花蕾均按时采摘，当蒴果成熟其顶端稍有裂开时摘下脱粒，晒干，贮存。

翌年5月中旬播种，播种前用25℃一30℃温水浸种l~2天，苗床做成1.33m×3.33m的小畦，便于管理，采取宽窄行种植，宽行23cm，窄行l0cm，株距l0cm，亩育苗4万株。开1.5cm浅沟点播种子，播下后盖一层细土，再薄铺一层疏松的腐烂的有机肥料或草叶，以保持苗床湿润，10天左右即可出苗。出苗后要及时灌水、拔草；伏雨季节还要浅锄2~3次，进行中耕松土，喷肥（肥液用3%的尿素液，亩喷施75kg），促其生长发育。

黄花菜种子繁殖的优点是：繁殖系数高，育苗成本低，根苗感病轻。

黄花菜种子繁殖的缺点是：繁殖速度较慢，春季播种，第二年夏季有5%的植株抽薹开花，秋季可根苗出圃到大田栽植，丰产期到第四年。远距离调种可采用种子繁殖。