诊断鱼病的方法一般有肉眼诊断和显微镜检查。

(1)肉眼诊断。一般病鱼的症状多数集中在体表、鳃部和肠道，故肉眼可直接看到它的病状和寄生虫情况，但要取刚死或未死的鲜病鱼作检查对象，否则，会误诊鱼病的真象。

1)体表目检。按顺序从头部、嘴、眼、鳃、鳞片、鳍条等仔细检查。对一些大型病原体，例如水霉、线虫、锚头鳋、鲺、钩介幼虫等均能见到。而小型病原体如口丝虫、斜管虫、三代虫、车轮虫等，只能根据表现病状来辨别。如鱼体发黑。背部肌肉发红，鳍基充血，口腔充血，肛门红肿，剥皮可见肌肉出血，为病毒性出血病或肠炎病。

2)鳃部检查。一般检查鱼的鳃丝有否异样，如鳃丝腐烂发白带黄色，尖端软骨外露，并沾有污泥和牯液，多为烂鳃病。

3)肠道检查。剖开鱼腹观察是否有线虫、舌状绦虫。

(2)显微镜检查。对于肉眼不能正确诊断或症状不明显的鱼病，一般需用显微镜作进一步检查。镜检通常是依据目检所确定的病灶进行。主要检查体表、鳃、肠道、眼、脑等部位。

检查方法：从病灶部位取少量组织或粘液，置于载玻片上，加入适量水，如属内脏组织，可用生理盐水(0．6%-0．8%)，盖上盖玻片，由低倍到高倍逐步检查，每个病变部位最好检查3个不同点。体表取其牯液镜检；鳃取少量鳃丝；肠道取前、中、后各段肠壁粘液检查。