二元式中央银行制度又称为二元复合式的中央银行制度，就是一国建立中央与地方两级相对独立的中央银行机构，分别行使金融调控和管理职能，不同等级的中央银行共同组成一个复合式统一的中央银行体系。

一般来说，地方级中央银行是按照当地经济特点、特定的法规和历史条件而设立，他们要受到中央级中央银行的监督与指导，但他们与中央级中央银行并非一般意义上的总分行关系，地方级中央银行在其辖区内有一定的独立性，中央级中央银行和地方级中央银行是按照法律规定分别行使其职能。

二元式中央银行制度具有权力与职能相对分散、分支机构较少等特点，一般是实行联邦制的国家所采用，如美国、德国等。