1、叶片区别：

牡丹的叶片通常为二回三出复叶，表面为绿色，无毛，背面为淡绿色，有时会有白粉，沿着叶脉有稀疏的短柔毛或是近无毛，叶柄长约5-11厘米。

芍药的下部叶为二回三出复叶，形状多样，表面为黄绿色，绿色以及深绿色等，背面为粉绿色，有毛或是无毛。

2、花的区别：

牡丹花单生长于枝的顶端，直径约10-17厘米，有5片花瓣或是重瓣，形状为倒卵形，花色多样，有红紫色，玫瑰色，粉红色后至白色等等，花期在5月份。

芍药花一般单生长于茎顶端或是近顶端的叶腋处，花朵和前者相比要小些，直径约8-11厘米，花瓣5-13片，形状倒卵形。如今园艺品种花色丰富多样，花瓣甚至可达上百枚。