两者的成分不同、应用不同、来源不同。

1、成分不同：辣椒精的成分含有辣椒的辛辣成分之外，还含有辣椒醇、蛋白质、果胶、多糖、辣椒红色素等百余种复杂的化学物质。天然辣的成分由十多种辣椒碱类化合物组成，其中主要有辣椒碱和二氢辣椒碱等。

2、应用不同：辣椒精将其喷洒在植物的叶、茎、果实和花上，可有效驱逐蚜虫、蜘蛛、食叶虫和跳蚤等。天然的辣椒碱产品主要用于药品的研发。

3、来源不同：辣椒精是从辣椒中提取、浓缩而得的一种产品。天然辣由茄科植物辣椒的成熟果实中提取得到的有效成分。