经车主同意的驾驶人驾驶车辆发生交通事故，保险公司应当根据保险合同约定进行理赔。因为机动车责任险是对车不对人，只要车辆已经投保，不管该车辆是谁驾驶，保险公司都会赔偿。

法律依据：《机动车交通事故责任强制保险条例》

第三条 本条例所称机动车交通事故责任强制保险，是指由保险公司对被保险机动车发生道路交通事故造成本车人员、被保险人以外的受害人的人身伤亡、财产损失，在责任限额内予以赔偿的强制性责任保险。

第二十一条 被保险机动车发生道路交通事故造成本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡、财产损失的，由保险公司依法在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。道路交通事故的损失是由受害人故意造成的，保险公司不予赔偿。