慢性牙根尖炎的治疗包括根管治疗、根尖手术或者是囊肿摘除术，拔除患牙。

由于大多数牙髓在细菌的慢性感染下坏死，因此不需要注射局部麻醉药即可研磨髓腔并去除冠髓和根髓。由于牙齿内有大量细菌积聚，需要放置樟脑酚等药物进行开放引流。2-3天后，完成根管预备，根管消毒后充填根管。如果X射线显示根尖不规则吸收，则需要在局部麻醉下切除受影响的根尖进行逆行填充。慢性根尖炎意味着不需要保留牙髓。此时，需要对牙齿进行系统的根管治疗。应使用动力系统打开牙髓，并移除牙髓，以便充分排空髓腔。特别是对于慢性根尖炎，需要更好地预防根尖炎症。在确定根尖炎症治愈后，用专用器械扩张根管，并用牙胶尖结合根管糊剂完全填充髓腔，这是根管治疗过程。然而，对于根管治疗后的牙齿，需要进行牙冠修复以保护牙齿。如果不加以保护，牙齿可能会受损或脱落。修复后的牙齿可以长时间继续发挥患者的咀嚼功能。慢性根尖周炎可以是慢性根尖周脓肿、慢性根尖周囊肿或慢性根尖周肉芽肿，所有这些都需要根管治疗。根管治疗可以清除感染病灶的坏死组织，然后通过根管准备、整形、消毒和抗炎药物促进根尖周病变的愈合。因此，慢性根尖周炎和慢性牙周炎都需要根管治疗。囊肿和肉芽肿可能尚未消失，因此可能还需要辅以根管切断术。对于炎症范围大、愈合时间长、存在根尖囊肿的牙齿，可能需要配合根尖手术或囊肿切除。这颗牙齿也可以保存。对于缺损过大且无治疗价值的牙齿，牙科医生可以选择合适的时候拔除。

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