独立学院只有本科，民办学院既有专科又有本科。民办学院有自己独立的毕业证书，而独立学院一般设在某个大学名下。独立学院的举办方一定是普通高校，合作方是社会力量，而民办则只有社会力量作为举办者。

1、民办高校是按照民办教育促进法设立的，而独立学院是教育部行政规章设立的。独立学院一定是本科，而民办高校专本科都有。

2、独立学院在举办方、学校的性质以及师资力量上都是有一定不同的，由于独立学院是和普通本科学院一起办学，所以在师资上可能会共享。而民办学校都是自己的师资。

3、民办院校都有自己的学校名称和自己的校园，也是自己独立颁发毕业证，组织机构也是自己的，而独立学院一般设在某个大学名下。

4、民办学院的发展时间比独立学院的发展时间长。