南京理工大学按照国家和江苏省的规定，向所有硕士研究生收取学费。

　　(1)全日制硕士研究生学费标准为：

　　学术学位8000元/生·学年;

　　会计硕士43200元/生·学年，中法工程师学院42000元/生·学年，其他专业学位10000元/生·学年。

　　(2)非全日制硕士研究生培养全过程学费标准为：

　　公共管理硕士(MPA)6万元，社会工作(MSW)6万元，工商管理硕士(MBA)13.8万元，会计硕士(MPAcc)12.8万元，法律硕士(非法学)5万元，高级管理人员工商管理硕士(EMBA)26万元，工程管理硕士(MEM)9.8万元，其他非全日制硕士均为4.5万元。