更新于2020年5月13日。

　　1.以下院系目前在鼓楼校区：

　　(南京市鼓楼区汉口路 22 号)

　　商学院、法学院、教育研究院、工程管理学院、体育科学研究所、中美文化研究中心、艺术学院、海外教育学院、数学系、物理学院、软件学院、医学院、建筑与城市规划学院。

　　2.以下院系目前在浦口校区：

　　(南京市浦口区学府路 12 号)

　　模式动物研究所。

　　3.以下院系目前在仙林校区：

　　(南京市栖霞区仙林大道 163 号)

　　哲学系、马克思主义学院、政府管理学院、社会学院、文学院、外国语学院、历史学院、新闻传播学院、国际关系研究院、信息管理学院、电子科学与工程学院、化学化工学院、环境学院、天文与空间科学学院、地理与海洋科学学院、大气科学学院、地球科学与工程学院、生命科学学院、计算机科学与技术系、现代工程与应用科学学院、人工智能学院、匡亚明学院。

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