农村的宅基地上房屋拆迁一般存在几种情形：新农村建设、城中村改造、行政村合并和国家为了公共利益的征收补偿。农村的宅基地上房屋拆迁补偿是房和地的分开补偿，“分开补偿”是指土地补偿和地上附着物补偿的分离。
新农村建设
1.新农村建设是指不改变农村集体土地的性质，按照《村民委员会组织法》的规定经民主表决同意，建设重新规划的新民居，拆除宅基地上房屋并给予适当补偿。此类拆迁补偿的合理标准：村民现有居住合法建筑的面积不得减少，生活水平不因此下降。
2.新农村建设不会撤销农村建制。被拆迁人可以在乡(镇)土地利用总体规划确定的中心村或居民点范围内申请宅基地新建住房，并获得相应的货币补偿。
行政村合并的房屋拆迁
1.《村民委员会组织法》第八条规定：村民委员会根据村民居住状况、人口多少，按照便于群众自治的原则设立。村民委员会的设立、撤销、范围调整，由乡、民族乡、镇的人民政府提出，经村民会议讨论同意后，报县级人民政府批准。由此可见，行政村合并的前提是，“经村民会议讨论同意”后政府履行批准手续。所以，合并行政村必须事先经过村民会议讨论同意。
2.行政村合并一般要撤销两个或者多个村建制。被征地的村或者村民小组建制撤销的，以及建制虽然不撤销，但不具备易地建房条件的，被拆迁人可以选择货币补偿，也可以选择与货币补偿金额同等价值的产权房屋调换。它的具体计算是：(被拆拆除房屋建安重置单价结合成新同区域新建多层商品住房每平方米建筑面积的土地使用权基价价格补贴)×被拆除房屋的建筑面积。
城中村改造城中村改造是指村民的身份已变为城镇居民，村民的宅基地业已变为国有，但是原有土地没有经过合法的征收补偿程序。在城中村改造中，拆除村民原有的宅基地上房屋，应要对宅基地进行集体土地变为国有土地的补偿，房屋也要按照现有用途参照周边同类房产的价格给予补偿或者安置。
国家对宅基地上房屋的征收补偿
1.国家征收农村宅基地上房屋，一般分为两种情况：一种是村里再提供宅基地重新建造的方式，这时候拆迁方应依照规定标准向被拆迁房屋的所有权人或使用人支付的各种补偿金。
第二种情况，如果本村不再提供宅基地，这种补偿比较复杂。一般情况下按照本地的地价和房屋重置价格进行补偿，会导致被拆迁人生活水平的下降，这与《土地管理法》的相关规定相违背。
2.具体补偿标准：房屋拆迁货币补偿合法拥有房产评估价格房屋装修装饰商定补偿金额(或经评估确定的房屋装修装饰补偿金额)；房屋拆迁补偿差价合法拥有房产评估价格房屋装修装饰商定补偿金额或经评估确定的房屋装修装饰补偿金额)-被拆迁人获得调换产权的房屋的评估价格；房屋拆迁安置费搬迁补助费没有提供周转房情况下的临时安置补助费超过过渡期限的临时安置补助费非住宅房屋因停产、停业造成的损失赔偿费。